Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CCINQ13939 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCINQ13939 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCINQ13939 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCINQ13939 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCINQ13939 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCINQ13939 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms