Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CUL3Q13618 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CUL3Q13618 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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