Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTA1Q13424 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms