Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SGCGQ13326 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SGCGQ13326 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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