Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SEMA3FQ13275 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SEMA3FQ13275 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms