Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NME3Q13232 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NME3Q13232 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NME3Q13232 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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NME3Q13232 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME3Q13232 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NME3Q13232 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NME3Q13232 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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NME3Q13232 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NME3Q13232 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NME3Q13232 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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