Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RESTQ13127 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RESTQ13127 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RESTQ13127 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RESTQ13127 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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RESTQ13127 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RESTQ13127 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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RESTQ13127 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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RESTQ13127 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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RESTQ13127 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
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RESTQ13127 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
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RESTQ13127 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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RESTQ13127 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RESTQ13127 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RESTQ13127 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
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