Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUSP4Q13115 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUSP4Q13115 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUSP4Q13115 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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