Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IFT88Q13099 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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IFT88Q13099 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IFT88Q13099 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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