Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRAF1Q13077 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
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TRAF1Q13077 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAF1Q13077 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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