Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MKRN3Q13064 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MKRN3Q13064 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
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