Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GRIK2Q13002 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIK2Q13002 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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