Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXF1Q12946 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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