Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SLC10A2Q12908 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC10A2Q12908 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms