Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF3C1Q12789 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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GTF3C1Q12789 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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