Protein–RNA interactions for Protein: Q12481

RRP36, rRNA biogenesis protein RRP36, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP36Q12481 YPL197CYPL197C 414 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 UFD2YDL190C 2886 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 KAP122YGL016W 3246 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YGL015CYGL015C 393 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 TIM10YHR005C-A 282 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YPR147CYPR147C 915 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 MSH3YCR092C 3057 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 LAA1YJL207C 6045 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 SMC4YLR086W 4257 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 CDC25YLR310C 4770 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 UTP13YLR222C 2454 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 AHC1YOR023C 1701 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 SPC1YJR010C-A 285 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YPR146CYPR146C 330 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 SEF1YBL066C 3447 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 SMB1YER029C 591 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 RPL42BYHR141C 321 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 RPL42AYNL162W 321 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YPR063CYPR063C 423 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 CHZ1YER030W 462 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 TIM18YOR297C 579 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 YPR096CYPR096C 303 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 VPS52YDR484W 1926 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP36Q12481 MSS11YMR164C 2277 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 RAD50YNL250W 3939 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 snR79snR79 84 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 snR9snR9 187 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 FCF2YLR051C 654 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YLR198CYLR198C 360 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 CSM4YPL200W 471 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 MSH5YDL154W 2706 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YDL211CYDL211C 1119 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 LRP1YHR081W 555 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 SEC28YIL076W 891 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YDR220CYDR220C 294 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 MND1YGL183C 660 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 ECM9YKR004C 1134 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 NBP1YLR457C 960 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 SGO1YOR073W 1773 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 snR83snR83 306 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 FSH1YHR049W 732 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 RCN1YKL159C 636 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 COX7YMR256C 183 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 RPL9BYNL067W 576 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 DCP1YOL149W 696 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 SPR3YGR059W 1539 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 CLU1YMR012W 3834 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 APL1YJR005W 2103 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 RPL40BYKR094C 387 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YSY6YBR162W-A 198 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 VPS54YDR027C 2670 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YGL217CYGL217C 342 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 YLL020CYLL020C 306 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 RPL33BYOR234C 324 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP36Q12481 ZIP1YDR285W 2628 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 IRR1YIL026C 3453 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SNO3YFL060C 669 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SNO2YNL334C 669 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 GAL7YBR018C 1101 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YCL046WYCL046W 324 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SLX4YLR135W 2247 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 ZRG17YNR039C 1818 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 HDA3YPR179C 1968 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 PRM8YGL053W 714 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SPO13YHR014W 876 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YLR271WYLR271W 825 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YMR254CYMR254C 309 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SWT1YOR166C 1377 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YLR366WYLR366W 306 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YGR130CYGR130C 2451 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YER121WYER121W 345 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YBR063CYBR063C 1215 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 NST1YNL091W 3723 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 GDS1YOR355W 1569 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SWI5YDR146C 2130 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 YGR283CYGR283C 1026 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SWS2YNL081C 432 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 AFR1YDR085C 1863 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP36Q12481 SPO75YLL005C 2607 nt1.16□□□□□ -2.22
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