Protein–RNA interactions for Protein: Q12211

PUS1, tRNA pseudouridine synthase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS1Q12211 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 FRE2YKL220C 2136 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 DIS3YOL021C 3006 nt3.52□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt3.51□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 TRX1YLR043C 312 nt3.51□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.51□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 XRN1YGL173C 4587 nt3.51□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 SSY1YDR160W 2559 nt3.51□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 SPT21YMR179W 2277 nt3.5□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 MSH4YFL003C 2637 nt3.5□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 KAP104YBR017C 2757 nt3.5□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 snR191snR191 274 nt3.5□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt3.5□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 MUS81YDR386W 1899 nt3.5□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 STU2YLR045C 2667 nt3.49□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt3.49□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 PHD1YKL043W 1101 nt3.49□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 ARG5,6YER069W 2592 nt3.49□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 TAO3YIL129C 7131 nt3.48□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 GIS4YML006C 2325 nt3.48□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 YSP2YDR326C 4317 nt3.48□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 CDC31YOR257W 486 nt3.48□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt3.47□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 FYV10YIL097W 1551 nt3.46□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 DUF1YOL087C 3351 nt3.46□□□□□ -1.85
PUS1Q12211 HEH2YDR458C 1992 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 TIM12YBR091C 330 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YJL181WYJL181W 1836 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 STE23YLR389C 3084 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YPK1YKL126W 2043 nt3.46□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 FRE8YLR047C 2061 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 FLO5YHR211W 3228 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YDL176WYDL176W 2127 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 CMC4YMR194C-B 222 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 HFM1YGL251C 3564 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 DFG16YOR030W 1860 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 RPA135YPR010C 3612 nt3.45□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 PSK1YAL017W 4071 nt3.44□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 STE6YKL209C 3873 nt3.44□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 TSC11YER093C 4293 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 TMN3YER113C 2121 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YTA7YGR270W 4140 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YDL118WYDL118W 381 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 DYN2YDR424C 279 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 RPL20BYOR312C 519 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 EXO84YBR102C 2262 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 STT4YLR305C 5703 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 CLN3YAL040C 1743 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 RCO1YMR075W 2055 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 MPT5YGL178W 2580 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 SLD3YGL113W 2007 nt3.43□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 AHC1YOR023C 1701 nt3.42□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 QCR7YDR529C 384 nt3.42□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YBR206WYBR206W 324 nt3.42□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 REC8YPR007C 2043 nt3.42□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 TRZ1YKR079C 2517 nt3.42□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 SEC63YOR254C 1992 nt3.42□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 PLC1YPL268W 2610 nt3.41□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YGL024WYGL024W 336 nt3.41□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YGL069CYGL069C 465 nt3.41□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt3.41□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 FPR1YNL135C 345 nt3.41□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 RPL23AYBL087C 414 nt3.41□□□□□ -1.86
PUS1Q12211 snR81snR81 201 nt3.4□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 GYL1YMR192W 2163 nt3.4□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 HAL9YOL089C 3093 nt3.4□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 DIA2YOR080W 2199 nt3.4□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 APL5YPL195W 2799 nt3.4□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 NOC3YLR002C 1992 nt3.4□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 HOS4YIL112W 3252 nt3.39□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 SOM1YEL059C-A 225 nt3.39□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 RPL20AYMR242C 519 nt3.39□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 KAR3YPR141C 2190 nt3.39□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 POL3YDL102W 3294 nt3.39□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 NTO1YPR031W 2247 nt3.39□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 SLP1YOR154W 1764 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 STF2YGR008C 255 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 CWC22YGR278W 1734 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 ITC1YGL133W 3795 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 YHR080CYHR080C 4038 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 YOR019WYOR019W 2193 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 NAB3YPL190C 2409 nt3.38□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 PRE4YFR050C 801 nt3.37□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 YIL058WYIL058W 285 nt3.37□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 YMR324CYMR324C 243 nt3.37□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 YCL046WYCL046W 324 nt3.37□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 SKP2YNL311C 2292 nt3.37□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 BNI4YNL233W 2679 nt3.37□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 RPA190YOR341W 4995 nt3.36□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 DSE4YNR067C 3354 nt3.36□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 CWH41YGL027C 2502 nt3.36□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 MET10YFR030W 3108 nt3.35□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 TIM11YDR322C-A 291 nt3.35□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 GRX8YLR364W 330 nt3.35□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 ZIP2YGL249W 2115 nt3.35□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 RAX2YLR084C 3663 nt3.35□□□□□ -1.87
PUS1Q12211 YCG1YDR325W 3108 nt3.35□□□□□ -1.87
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