Protein–RNA interactions for Protein: Q12104

SWT1, Transcriptional protein SWT1, yeastyeast

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWT1Q12104 CLN3YAL040C 1743 nt2.2□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 ESL2YKR096W 3588 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 BCK1YJL095W 4437 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YKL136WYKL136W 399 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 GIP3YPL137C 3831 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YPL229WYPL229W 621 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 VMA9YCL005W-A 222 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 SEF1YBL066C 3447 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YBR184WYBR184W 1572 nt2.19□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 SET2YJL168C 2202 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 PHO91YNR013C 2685 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 MNE1YOR350C 1992 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 PHS1YJL097W 654 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 TIM18YOR297C 579 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YSY6YBR162W-A 198 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 MNL2YLR057W 2550 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 TMN3YER113C 2121 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 TCB2YNL087W 3537 nt2.18□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.17□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 RPA34YJL148W 702 nt2.17□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 ABM1YJR108W 372 nt2.17□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 PSY1YKL076C 384 nt2.17□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YBL083CYBL083C 426 nt2.17□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 RPO41YFL036W 4056 nt2.17□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 SNF5YBR289W 2718 nt2.16□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YKL118WYKL118W 312 nt2.16□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 RPS27AYKL156W 249 nt2.16□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.16□□□□□ -2.06
SWT1Q12104 YDR102CYDR102C 333 nt2.15□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 RPL27BYDR471W 411 nt2.15□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 KTI11YBL071W-A 249 nt2.15□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 SEC26YDR238C 2922 nt2.15□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 BUB1YGR188C 3066 nt2.14□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 VPH1YOR270C 2523 nt2.14□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 GUP1YGL084C 1683 nt2.14□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 SLM1YIL105C 2061 nt2.14□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 ALK2YBL009W 2031 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 FKS3YMR306W 5358 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 TOF1YNL273W 3717 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YPL216WYPL216W 3309 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 IST2YBR086C 2841 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YDR008CYDR008C 351 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 DFG16YOR030W 1860 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 BNI1YNL271C 5862 nt2.13□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 TUS1YLR425W 3924 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 ARP8YOR141C 2646 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 TRL1YJL087C 2484 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YBP1YBR216C 2025 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YCR043CYCR043C 384 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 VPS8YAL002W 3825 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 SMC6YLR383W 3345 nt2.12□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 NHP2YDL208W 471 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 PRE4YFR050C 801 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YLR053CYLR053C 327 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YOR055WYOR055W 435 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 PAC1YOR269W 1485 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 ZRG8YER033C 3231 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 IRR1YIL026C 3453 nt2.11□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 PEX8YGR077C 1770 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 VTC3YPL019C 2508 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 MLH1YMR167W 2310 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 snR70snR70 164 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YDL062WYDL062W 426 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YHL037CYHL037C 402 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 RPL42BYHR141C 321 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YNL114CYNL114C 372 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 RPL42AYNL162W 321 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 HHT1YBR010W 411 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 RTT107YHR154W 3213 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 SGO1YOR073W 1773 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 RKM1YPL208W 1752 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 TOR1YJR066W 7413 nt2.1□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.09□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 YIL059CYIL059C 366 nt2.09□□□□□ -2.07
SWT1Q12104 VPS34YLR240W 2628 nt2.09□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 SAP185YJL098W 3177 nt2.09□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 RTT101YJL047C 2529 nt2.09□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 USO1YDL058W 5373 nt2.09□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 PDR1YGL013C 3207 nt2.08□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 CSN9YDR179C 489 nt2.08□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YDR413CYDR413C 576 nt2.08□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YER097WYER097W 330 nt2.08□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.08□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.08□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YDR341CYDR341C 1824 nt2.07□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 GRR1YJR090C 3456 nt2.07□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YHL041WYHL041W 450 nt2.07□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.07□□□□□ -2.08
SWT1Q12104 CYB5YNL111C 363 nt2.07□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 50.3 ms