Protein–RNA interactions for Protein: Q12100

RTK1, Probable serine/threonine-protein kinase RTK1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTK1Q12100 CDC53YDL132W 2448 nt2.43□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YBR184WYBR184W 1572 nt2.43□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 AXL1YPR122W 3627 nt2.43□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 CDC27YBL084C 2277 nt2.43□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 MNL2YLR057W 2550 nt2.43□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 NOT5YPR072W 1683 nt2.42□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 RBK1YCR036W 1002 nt2.42□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YDR413CYDR413C 576 nt2.42□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 SGM1YJR134C 2124 nt2.42□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 PAN3YKL025C 2040 nt2.42□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 SCH9YHR205W 2475 nt2.42□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YKU80YMR106C 1890 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 DFG16YOR030W 1860 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 ALK2YBL009W 2031 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 TOR1YJR066W 7413 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YDR102CYDR102C 333 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YGL069CYGL069C 465 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 ACM1YPL267W 630 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YCL023CYCL023C 348 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 YLR149CYLR149C 2193 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 TRA1YHR099W 11235 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 NUP120YKL057C 3114 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 ISW1YBR245C 3390 nt2.41□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 SCP160YJL080C 3669 nt2.4□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 PEP3YLR148W 2757 nt2.4□□□□□ -2.02
RTK1Q12100 NHP2YDL208W 471 nt2.4□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 VTC1YER072W 390 nt2.4□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 RPL14BYHL001W 417 nt2.4□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 HCH1YNL281W 462 nt2.4□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YBR224WYBR224W 516 nt2.4□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YBP1YBR216C 2025 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 KRE33YNL132W 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 ORC2YBR060C 1863 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SEF1YBL066C 3447 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SMC6YLR383W 3345 nt2.39□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SEC26YDR238C 2922 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YER181CYER181C 324 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YIL059CYIL059C 366 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 RPL39YJL189W 156 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 KTI11YBL071W-A 249 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 snR36snR36 182 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SWR1YDR334W 4545 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 PSD2YGR170W 3417 nt2.38□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.37□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YIL080WYIL080W 4722 nt2.37□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 LYS9YNR050C 1341 nt2.37□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SPO22YIL073C 2928 nt2.37□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 APL5YPL195W 2799 nt2.37□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 IRA2YOL081W 9240 nt2.37□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 VPH1YOR270C 2523 nt2.36□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YER097WYER097W 330 nt2.36□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 RKM1YPL208W 1752 nt2.36□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 MGM1YOR211C 2646 nt2.36□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 TMN3YER113C 2121 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YFL032WYFL032W 321 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 PHS1YJL097W 654 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 RPL32YBL092W 393 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SSQ1YLR369W 1974 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 PEX8YGR077C 1770 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SGO1YOR073W 1773 nt2.35□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SET2YJL168C 2202 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SRO77YBL106C 3033 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 BNR1YIL159W 4128 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 TUS1YLR425W 3924 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 SLM1YIL105C 2061 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 ZRG8YER033C 3231 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YOR333CYOR333C 417 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 DAD3YBR233W-A 285 nt2.34□□□□□ -2.03
RTK1Q12100 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.33□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 YDR286CYDR286C 345 nt2.33□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PAU8YAL068C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PAU20YOL161C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 HHT1YBR010W 411 nt2.33□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 STB4YMR019W 2850 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 SIR3YLR442C 2937 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 RPA34YJL148W 702 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 YBL083CYBL083C 426 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 MNE1YOR350C 1992 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 YEF3YLR249W 3135 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PDR1YGL013C 3207 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PAC1YOR269W 1485 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PHO91YNR013C 2685 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 VMR1YHL035C 4779 nt2.32□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 MET18YIL128W 3099 nt2.31□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 STH1YIL126W 4080 nt2.31□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 snR65snR65 100 nt2.31□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 ATP7YKL016C 525 nt2.31□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PHO2YDL106C 1680 nt2.31□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 STE5YDR103W 2754 nt2.3□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 RPS17AYML024W 411 nt2.3□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 CLN3YAL040C 1743 nt2.3□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 EFR3YMR212C 2349 nt2.3□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 ATG11YPR049C 3537 nt2.29□□□□□ -2.04
RTK1Q12100 PUT3YKL015W 2940 nt2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.4 ms