Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
AP1B1Q10567 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
AP1B1Q10567 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms