Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NCBP1Q09161 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NCBP1Q09161 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms