Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
RBBP4Q09028 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms