Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PUDPQ08623 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PUDPQ08623 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms