Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TFF3Q07654 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TFF3Q07654 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms