Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CACNG1Q06432 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG1Q06432 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms