Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 YER175W-AYER175W-A 165 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 YIL029CYIL029C 429 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 YKL123WYKL123W 381 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 AFB1YLR040C 675 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 GMC2YLR445W 567 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 PGA1YNL158W 597 nt1.17□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 MDM20YOL076W 2391 nt1.16□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 PEP3YLR148W 2757 nt1.16□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 PRM8YGL053W 714 nt1.16□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 PET123YOR158W 957 nt1.16□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 SEY1YOR165W 2331 nt1.16□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 YJR098CYJR098C 1971 nt1.16□□□□□ -2.22
NEJ1Q06148 snR79snR79 84 nt1.15□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YGR283CYGR283C 1026 nt1.15□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 MSC6YOR354C 2079 nt1.15□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YGR250CYGR250C 2346 nt1.15□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 IRE1YHR079C 3348 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 TRM732YMR259C 4263 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 LAA1YJL207C 6045 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YHL037CYHL037C 402 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YJL015CYJL015C 285 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 SPC1YJR010C-A 285 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YJR079WYJR079W 330 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 MCM22YJR135C 720 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YSW1YBR148W 1830 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 CTR9YOL145C 3234 nt1.14□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YDL016CYDL016C 303 nt1.13□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 OCA6YDR067C 675 nt1.13□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 IES5YER092W 378 nt1.13□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt1.13□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YAR068WYAR068W 486 nt1.13□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 MDS3YGL197W 4464 nt1.13□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 NOP53YPL146C 1368 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 HNT1YDL125C 477 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YDR029WYDR029W 315 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 SMB1YER029C 591 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 CGI121YML036W 546 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 UBX4YMR067C 1251 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 SMC4YLR086W 4257 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 SMY1YKL079W 1971 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 HMI1YOL095C 2121 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 MLH3YPL164C 2148 nt1.12□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 SNF5YBR289W 2718 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 CRG1YHR209W 876 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 IRC16YPR038W 360 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 NUP120YKL057C 3114 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 RLM1YPL089C 2031 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 COX1Q0045 1605 nt1.11□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 GUP1YGL084C 1683 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YBR184WYBR184W 1572 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YJR141WYJR141W 1044 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YKL044WYKL044W 321 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 BER1YLR412W 825 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 PKR1YMR123W 369 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YSY6YBR162W-A 198 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 DOT6YER088C 2013 nt1.1□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YER121WYER121W 345 nt1.09□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 RPL42BYHR141C 321 nt1.09□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 FCF2YLR051C 654 nt1.09□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 RPL42AYNL162W 321 nt1.09□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 YPR146CYPR146C 330 nt1.09□□□□□ -2.23
NEJ1Q06148 CDC24YAL041W 2565 nt1.09□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SNU56YDR240C 1479 nt1.09□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 APL1YJR005W 2103 nt1.08□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 GAL7YBR018C 1101 nt1.08□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SLM6YBR266C 453 nt1.08□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 PPN1YDR452W 2025 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 RPL34BYIL052C 366 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 YJL022WYJL022W 309 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 ILM1YJR118C 612 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 CTK3YML112W 891 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SVS1YPL163C 783 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 YCL046WYCL046W 324 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 MMS22YLR320W 4365 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SEF1YBL066C 3447 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 OSH6YKR003W 1347 nt1.07□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 MSS11YMR164C 2277 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 SPT7YBR081C 3999 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 VAM6YDL077C 3150 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 QCR7YDR529C 384 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 RRT15YLR162W-A 189 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 EGD1YPL037C 474 nt1.06□□□□□ -2.24
NEJ1Q06148 ALK1YGL021W 2283 nt1.05□□□□□ -2.24
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