Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNB3Q05901 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNB3Q05901 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms