Protein–RNA interactions for Protein: Q05900

YHC1, U1 small nuclear ribonucleoprotein C, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHC1Q05900 VPS8YAL002W 3825 nt1.69□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 LYS9YNR050C 1341 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 CHC1YGL206C 4962 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 STB4YMR019W 2850 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 AGA2YGL032C 264 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 URM1YIL008W 300 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 NAM7YMR080C 2916 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YLR149CYLR149C 2193 nt1.68□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 DOT6YER088C 2013 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 TMA22YJR014W 597 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 NFU1YKL040C 771 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 HSK3YKL138C-A 210 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YLR053CYLR053C 327 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 PEP3YLR148W 2757 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 HER1YOR227W 3741 nt1.67□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 RTT107YHR154W 3213 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YDL062WYDL062W 426 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 RPL37BYDR500C 267 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YLR287CYLR287C 1068 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 DIE2YGR227W 1578 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 YBR184WYBR184W 1572 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 SLM1YIL105C 2061 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 SYH1YPL105C 2550 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 LHS1YKL073W 2646 nt1.66□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 GRR1YJR090C 3456 nt1.65□□□□□ -2.14
YHC1Q05900 RBK1YCR036W 1002 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 QCR7YDR529C 384 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YML084WYML084W 309 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YBL083CYBL083C 426 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 MKT1YNL085W 2493 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YJR098CYJR098C 1971 nt1.65□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 RPH1YER169W 2391 nt1.64□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.64□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.64□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.64□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 CAT2YML042W 2013 nt1.64□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 FAB1YFR019W 6837 nt1.64□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 SDH7YDR511W 402 nt1.63□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YHR210CYHR210C 1026 nt1.63□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.63□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 PGA1YNL158W 597 nt1.63□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.63□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 UBP1YDL122W 2430 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 CBS1YDL069C 690 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 CYB5YNL111C 363 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YBL071CYBL071C 309 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YOL159CYOL159C 516 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YPR099CYPR099C 357 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 SPO23YBR250W 1572 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 SIR4YDR227W 4077 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 SEF1YBL066C 3447 nt1.62□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 ZRG8YER033C 3231 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 MMS22YLR320W 4365 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 TUS1YLR425W 3924 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YDR157WYDR157W 402 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YPL182CYPL182C 384 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 UTP21YLR409C 2820 nt1.61□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YCR043CYCR043C 384 nt1.6□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.6□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 SWF1YDR126W 1011 nt1.6□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 LEE1YPL054W 906 nt1.6□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 MYO4YAL029C 4416 nt1.6□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 PAN3YKL025C 2040 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 GNT1YOR320C 1476 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YMR045CYMR045C 5268 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 TOF2YKR010C 2316 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YDR269CYDR269C 324 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YER079WYER079W 633 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 RPS24BYIL069C 408 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 YBR285WYBR285W 435 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 CFT1YDR301W 4074 nt1.59□□□□□ -2.15
YHC1Q05900 UBR2YLR024C 5619 nt1.59□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YDL152WYDL152W 366 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YGL239CYGL239C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 RPL42BYHR141C 321 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 RPL42AYNL162W 321 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 MRPL50YNR022C 420 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YOR053WYOR053W 342 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YPL185WYPL185W 396 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 MGA2YIR033W 3342 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.58□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 ARP7YPR034W 1434 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 PLC1YPL268W 2610 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 TFC8YPL007C 1767 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 DFG16YOR030W 1860 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 BTT1YDR252W 450 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 RTT102YGR275W 474 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 TMA7YLR262C-A 195 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 CGI121YML036W 546 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 UBC7YMR022W 498 nt1.57□□□□□ -2.16
YHC1Q05900 YOR146WYOR146W 306 nt1.57□□□□□ -2.16
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