Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CALD1Q05682 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CALD1Q05682 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms