Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SSBP1Q04837 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms