Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LINC01221-201ENST00000432488 662 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LINC00571-201ENST00000434565 521 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC096631.1-202ENST00000440162 917 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LINC01393-202ENST00000435981 1187 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AL136981.1-204ENST00000425090 461 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNB1Q02641 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms