Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SP4Q02446 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SP4Q02446 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SP4Q02446 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SP4Q02446 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SP4Q02446 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SP4Q02446 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP4Q02446 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP4Q02446 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP4Q02446 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SP4Q02446 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SP4Q02446 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms