Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BEX3Q00994 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BEX3Q00994 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms