Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GTF2BQ00403 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms