Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NUCB2P80303 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms