Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM193AP78312 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM193AP78312 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms