Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIK1P57059 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIK1P57059 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIK1P57059 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIK1P57059 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIK1P57059 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIK1P57059 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIK1P57059 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIK1P57059 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms