Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EPHB4P54760 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EPHB4P54760 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms