Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CACNA2D1P54289 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CACNA2D1P54289 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms