Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms