Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
UBE2E1P51965 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms