Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLCN3P51790 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CLCN3P51790 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms