Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HOXA1P49639 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA1P49639 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms