Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LHX1P48742 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LHX1P48742 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LHX1P48742 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LHX1P48742 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LHX1P48742 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LHX1P48742 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LHX1P48742 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms