Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CDKN1BP46527 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CDKN1BP46527 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms