Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMPOP42166 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMPOP42166 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMPOP42166 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMPOP42166 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
TMPOP42166 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMPOP42166 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms