Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTGDSP41222 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTGDSP41222 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms