Protein–RNA interactions for Protein: P41162

ETV3, ETS translocation variant 3, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV3P41162 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV3P41162 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ETV3P41162 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ETV3P41162 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ETV3P41162 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ETV3P41162 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ETV3P41162 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ETV3P41162 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ETV3P41162 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV3P41162 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ETV3P41162 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.6 ms