Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 MUM2YBR057C 1101 nt0.32□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 GDS1YOR355W 1569 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 AI4Q0065 1671 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 VAB2YEL005C 849 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 LAG1YHL003C 1236 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 EMC5YIL027C 426 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 HHT1YBR010W 411 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 RRP15YPR143W 753 nt0.31□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 TMA20YER007C-A 546 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YER046W-AYER046W-A 330 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 VPS25YJR102C 609 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 POP8YBL018C 402 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 IRC23YOR044W 474 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 SWT1YOR166C 1377 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 AEP1YMR064W 1557 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 COG7YGL005C 840 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 EDC1YGL222C 528 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 DLT1YMR126C 1029 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YNR021WYNR021W 1215 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 BRX1YOL077C 876 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 MUD2YKL074C 1584 nt0.3□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YET2YMR040W 483 nt0.29□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 MMS2YGL087C 414 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YGL109WYGL109W 324 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YGL217CYGL217C 342 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YIR020CYIR020C 303 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YOL150CYOL150C 312 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 VPS28YPL065W 729 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 ICS2YBR157C 768 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 NTC20YBR188C 423 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YBR224WYBR224W 516 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 SGO1YOR073W 1773 nt0.28□□□□□ -2.36
YRF1-2P40105 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt0.28□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YGR045CYGR045C 363 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YLL020CYLL020C 306 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 GRX8YLR364W 330 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 SLD5YDR489W 885 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 MZM1YDR493W 372 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 RSM28YDR494W 1086 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 ULI1YFR026C 510 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 VMA7YGR020C 357 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 IES4YOR189W 351 nt0.27□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 OSH6YKR003W 1347 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YCR043CYCR043C 384 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 snR63snR63 255 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 RTR1YER139C 681 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 SUT2YPR009W 807 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 NUR1YDL089W 1455 nt0.26□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 SLS1YLR139C 1932 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YJL114WYJL114W 681 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 RPC25YKL144C 639 nt0.25□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 MXR1YER042W 555 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YFL012W-AYFL012W-A 375 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YMR324CYMR324C 243 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 RPL9BYNL067W 576 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 PGA1YNL158W 597 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 GPX2YBR244W 489 nt0.24□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 PXA2YKL188C 2562 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 MAM1YER106W 909 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YKE2YLR200W 345 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YPR142CYPR142C 564 nt0.23□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 HDA3YPR179C 1968 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 CGI121YML036W 546 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 IZH4YOL101C 939 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 SPT21YMR179W 2277 nt0.22□□□□□ -2.37
YRF1-2P40105 YDL196WYDL196W 330 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 snR13snR13 124 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 RCN1YKL159C 636 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YAL064WYAL064W 285 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YLR031WYLR031W 561 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 NEJ1YLR265C 1029 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 GMC2YLR445W 567 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 NBP1YLR457C 960 nt0.21□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YDR262WYDR262W 819 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 MRPL50YNR022C 420 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YOL024WYOL024W 519 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YBR012CYBR012C 420 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YBR051WYBR051W 351 nt0.2□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 SPC2YML055W 537 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 FAR3YMR052W 615 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 RPL32YBL092W 393 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 NDD1YOR372C 1665 nt0.19□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YCR016WYCR016W 873 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YER147C-AYER147C-A 411 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 ATP18YML081C-A 180 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 MLP1YKR095W 5628 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 TOF2YKR010C 2316 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 NUT2YPR168W 474 nt0.18□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 SWF1YDR126W 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YDR199WYDR199W 366 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 BMT5YIL096C 1011 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 YJL032WYJL032W 315 nt0.17□□□□□ -2.38
YRF1-2P40105 HYM1YKL189W 1200 nt0.17□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.2 ms