Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATP5C1P36542 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATP5C1P36542 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms